针对您提出的“施工合同长期停工损失怎么判决赔偿”的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
首先，要确定停工损失的计算和承担，关键在于明确停工原因的责任归属。根据《民法典》的相关规定，我们可以将责任划分为以下几种情况：
发包人过错：
- 情形包括：未按约提供施工场地、图纸或支付工程款；擅自变更设计或指令停工；未办理建设审批手续导致行政停工。
- 在这些情况下，由发包人承担停工损失。例如，如果工程因发包人未完成拆迁导致停工180天，法院将判决发包人承担全部损失。
承包人过错：
- 情形包括：施工组织不力、质量返工或人员不足；未按合同约定申请工期顺延（如逾期未提交停工报告）。
- 在这些情况下，承包人需要承担部分或全部停工损失。例如，如果承包人因劳务纠纷停工，法院可能会认定其自行承担60%的损失。
不可抗力与意外事件：
- 情形包括：极端天气、政策突变等不可归责于双方的原因。
- 在这种情况下，损失由双方各自承担，但发包人应给予工期顺延。
接下来，关于停工损失的具体计算，通常包括以下几个方面：
- 机械停滞费：租赁设备按日租金乘以停滞天数计算，自有设备则按折旧费加维护费（需扣除20%的自然损耗）计算。
- 周转材料损失：如模板、脚手架等，按闲置时长乘以日摊销费计算，但需排除可转移至其他项目的合理使用部分。
- 管理费：根据停工期间项目部实际支出的办公费、差旅费等计算，需与施工规模相匹配。
- 间接损失：如预期利润，仅支持已完工程部分的合理利润（合同利润率或行业平均5%-8%）；资金占用利息则按同期LPR计算，自应付之日起算。
最后，在证据审查方面，需要注意以下几点：
- 停工时间的认定：应提供经发包人或监理签字的《停工通知》《工期顺延申请》；无书面通知时，应结合监理日志、工程联系单等形成证据链。
- 损失金额的举证：需要提供人工（劳动合同、社保记录、工资表）、机械（购置/租赁合同、油耗记录）以及其他相关证据（现场签证单、监理例会纪要、损失计算表等），且损失计算表最好由第三方造价机构盖章确认。
- 司法鉴定的启动：对争议较大的损失项目，法院可委托进行司法鉴定，鉴定报告需明确停工对关键线路的影响以及损失计算的市场行情依据。
综上所述，施工合同长期停工损失的判决赔偿是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑责任归属、损失计算以及证据审查等多个方面。希望这个解答能够对您有所帮助。