在商家货物存在质量问题的情况下，买家不能直接扣除卖家的钱款。下面我将从法律角度详细解释这一结论，并给出相应的建议。
法律解释
合同义务与违约责任：
- 在货物买卖合同中，卖家有义务按照合同约定的质量、规格等要求交付货物。
- 如果卖家交付的货物存在质量问题，即违反了合同义务，构成违约。
- 买家可以要求卖家承担违约责任，但并不能直接扣除卖家的钱款作为赔偿。
抗辩事由与反诉：
- 买家不能以货物存在质量问题为由直接拒绝支付货款，因为这并不构成抗辩事由。
- 如果买家认为货物质量问题给自己造成了损失，应当提起反诉，要求卖家赔偿损失。
- 在反诉中，买家需要举证证明货物存在质量问题以及因此造成的具体损失。
法律程序：
- 如果买卖双方无法就货款支付和质量问题达成一致，买家可以通过法律途径解决争议。
- 买家可以向法院提起诉讼，要求卖家承担违约责任并赔偿损失。
- 法院将根据证据和法律规定，对案件进行审理并作出判决。
建议
沟通协商：
- 在发现货物质量问题后，买家应首先与卖家进行沟通协商，尝试达成解决方案。
- 双方可以协商退货、换货、降价或赔偿等处理方式。
保留证据：
- 买家应妥善保留货物存在质量问题的证据，如照片、视频、检验报告等。
- 这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
提起反诉：
- 如果卖家拒绝承担责任或双方无法达成一致，买家可以向法院提起反诉。
- 在反诉中，买家需要明确诉讼请求和事实理由，并提供充分的证据支持自己的主张。
寻求法律援助：
- 如果买家在法律程序中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师的法律援助。
- 律师将根据具体情况为买家提供法律建议和指导。
综上所述，买家在发现商家货物存在质量问题时，不能直接扣除卖家的钱款。而是应通过沟通协商、保留证据、提起反诉等合法途径来维护自己的权益。如果你有任何进一步的法律问题或需要具体的法律建议，请随时向我咨询。