合伙企业投资的公司进行章程变更，一般不会直接影响合伙协议的履行。但这个问题需要从多个角度进行细致分析：

1. 合伙协议与公司章程的独立性：

   • 合伙协议是合伙企业成立的基础文件，它规定了合伙人之间的权利、义务及合伙企业的运营规则。
   • 公司章程则是公司设立时由股东共同制定的，规定公司内部管理和外部关系的法律文件。
   • 两者在法律上是独立的，各自约束不同的主体和行为。

2. 章程变更的性质：

   • 公司章程的变更通常涉及公司内部的治理结构、经营范围、股东权利等事项的调整。
   • 这些变更主要影响的是公司股东之间的法律关系，以及公司与外部第三人的法律关系。

3. 合伙协议与公司章程的关联：

   • 虽然合伙协议和公司章程在法律上是独立的，但在某些情况下，合伙企业作为公司的股东，其在公司中的权益可能受到公司章程变更的影响。
   • 例如，如果公司章程的变更影响了合伙企业的股东权利，如分红权、表决权等，那么这些变更可能间接影响到合伙协议的履行。

4. 合伙协议的约定：

   • 合伙协议中可能包含对公司章程变更的特别约定，如需要合伙人一致同意或特定比例的合伙人同意等。
   • 如果合伙协议中有此类约定，那么公司章程的变更就必须遵循这些约定，否则可能构成对合伙协议的违反。

5. 法律后果：

   • 如果公司章程的变更没有违反合伙协议的约定，且没有直接损害合伙企业的利益，那么合伙协议的履行通常不会受到影响。
   • 但如果公司章程的变更违反了合伙协议的约定，或者损害了合伙企业的利益，那么合伙人可以依据合伙协议寻求法律救济，如要求违约方承担违约责任等。

综上所述，合伙企业投资的公司进行章程变更，一般不会直接影响合伙协议的履行。但具体是否会影响，还需要根据合伙协议的具体内容、公司章程变更的性质以及两者之间的关联关系来综合判断。如果您在这方面有具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为您提供更详细和专业的法律建议。