酒店转让收取转让费是否无效，需具体分析合同内容及实际情况，不可一概而论。以下结合您提供的案例进行分析：
一. 案例分析
在您提供的“杨某某与王某某、王某某确认合同无效纠纷一审民事判决书”案例中，原告杨某某主张与被告王某某、王某某签订的《宾馆转让责任书》无效，并要求返还转让费及赔偿利息损失。其主张合同无效的主要理由是认为被告转让行政许可不合法，违反了《中华人民共和国行政许可法》第九条的规定。
然而，法院在审理后认为，原、被告之间达成的宾馆转让协议并签订了《宾馆转让责任书》，对双方有约束力。对于开办宾馆所需的行政许可，可向相关部门申请取得，没有所需证件或证件不齐，并不是法律或行政法规的强制性规定。因此，原告杨某某主张合同无效的理由不成立，其要求退还转让费并按银行贷款利率支付利息的诉讼请求也未得到支持。
二. 法律观点
合同效力：根据《中华人民共和国合同法》第四十四条，依法成立的合同，自成立时生效。除非存在《合同法》第五十二条规定的情形，否则合同一经签订即具有法律效力。在此案例中，法院认为宾馆转让协议对双方有约束力，并未认定合同无效。
行政许可与合同效力：开办宾馆所需的行政许可属于行政管理范畴，与合同效力无直接关联。即使转让时证件不齐，也不必然导致合同无效。当事人可以通过后续申请取得所需证件，以满足经营条件。
三. 结论与建议
综上所述，酒店转让收取转让费是否无效，需根据合同具体内容及实际情况进行判断。在此案例中，法院并未支持原告关于合同无效的主张。因此，在酒店转让过程中，双方应明确合同内容，确保合同合法有效，并妥善处理行政许可等相关事宜。
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