如果借款人已经根据总账流水还清借款，但债权人仍然要求归还本金，借款人应首先核实还款记录，并通过法律途径解决争议。

一. 核实还款记录

1. 检查转账记录：借款人应详细检查所有与债权人的转账记录，确保每一笔还款都已准确记录，并且与总账流水相符。
2. 确认收款人信息：核实还款是否确实转入了债权人的账户，以避免因转错账户而产生的误会。
3. 保留证据：保存所有与还款相关的证据，如转账凭证、银行流水等，以备后续可能的法律纠纷。

二. 通过法律途径解决争议

1. 沟通协商：首先，借款人应与债权人进行沟通，尝试解释并展示还款记录，以达成和解。
2. 寻求法律援助：如果沟通无果，借款人可以寻求法律援助，咨询专业律师（在此情况下，即我本人）以了解自身权益和可能的法律途径。
3. 提起诉讼：在必要时，借款人可以根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，向人民法院提起诉讼，要求确认借款已经还清，并请求法院判令债权人停止不当追讨。根据《民法典》第六百七十九条：“自然人之间的借款合同，自贷款人提供借款时成立”。若借款人能提供确凿证据证明已归还本金，则债权人的进一步追讨将缺乏法律依据。

• 例如，如果借款人通过银行转账方式还清了借款，并且保留了转账凭证和银行流水，那么这些证据将有力地支持借款人的主张。

我建议，在处理此类纠纷时，借款人应保持冷静，理性应对。在核实还款记录的基础上，积极与债权人沟通，并寻求法律援助以维护自身权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。