挂靠人与被挂靠人之间因工程款未付清的问题，主要适用《中华人民共和国民法典》的相关条款，特别是关于合同履行的规定。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律适用分析

1. 合同关系：挂靠人与被挂靠人之间通常存在某种形式的合同关系，无论是书面还是口头。这种合同关系受到《中华人民共和国民法典》的保护和约束。
2. 工程款支付：工程款未付清属于合同履行中的违约行为。根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任”。
3. 挂靠关系的特殊性：虽然挂靠关系在法律上可能不被完全认可，但挂靠人与被挂靠人之间的工程款支付问题仍然可以依据合同法的原则进行处理。法院在审理此类案件时，通常会根据双方的实际合同关系和履行情况来判断责任。

二. 实际案例理解

• 例如，甲（挂靠人）与乙（被挂靠人）约定，甲以乙的名义承接某工程项目，乙在收到工程款后应支付给甲。若乙未按照约定支付工程款，甲可以依据《中华人民共和国民法典》关于合同履行的规定，向法院提起诉讼，要求乙承担违约责任。

三. 结论与建议

综上所述，挂靠人与被挂靠人之间因工程款未付清的问题，主要适用《中华人民共和国民法典》中关于合同履行的规定。我建议你在处理此类问题时，首先检查双方之间的合同条款，明确各自的权利和义务。若存在争议，可以寻求法律途径解决，如向法院提起诉讼或申请仲裁。如有进一步需要，您可以继续咨询我。