不按规定注销农民工工资专用账户，可能会对施工总承包单位产生一系列不利影响，包括但不限于行政责任、影响企业信誉以及可能的法律责任。具体分析如下：

一. 可能面临行政责任

• 根据相关法律法规，农民工工资专用账户是保障农民工工资权益的重要措施。若施工总承包单位在项目竣工、合同解除或建设项目停止建设后，未按规定注销农民工工资专用账户，可能会被视为未履行相应的法律义务。
• 这种情况下，人力资源社会保障行政部门或行业工程建设主管部门有权对施工总承包单位进行行政处罚，如罚款、通报批评等。

二. 影响企业信誉

• 不按规定注销农民工工资专用账户可能会被视为企业管理不规范、不遵守法律法规的表现。
• 这将对企业信誉造成负面影响，影响企业在行业内的声誉和竞争力，甚至可能影响企业未来的业务合作和发展。

三. 可能的法律责任

• 若因未注销农民工工资专用账户导致农民工工资权益受损，施工总承包单位可能需要承担相应的法律责任。
• 例如，若农民工因工资支付问题提起诉讼，法院可能会判决施工总承包单位承担赔偿责任。

我建议：施工总承包单位应严格遵守相关法律法规，按规定设立、使用和注销农民工工资专用账户。在项目竣工、合同解除或建设项目停止建设后，应及时办理账户注销手续，以确保自身合法权益，同时避免不必要的法律风险和损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。