政府采购法第49条与工程变更的区别主要在于它们所规范的内容和适用的场景不同。

1. 政府采购法第49条：

   • 内容：该条款主要规范的是政府采购合同履行中的相关问题，特别是关于采购人追加与合同标的相同的货物、工程或者服务的采购金额的处理方式。具体来说，如果追加的采购金额不超过原合同采购金额的百分之十，那么可以在不改变合同其他条款的前提下，与原供应商签订补充合同进行采购；但如果追加的采购金额超过了原合同采购金额的百分之十，那么就需要按照新的采购程序重新进行采购。
   • 适用场景：这一条款主要适用于政府采购活动中，当采购人需要追加采购与原有合同标的相同的货物、工程或服务时的情况。

2. 工程变更：

   • 内容：工程变更通常指的是在工程项目实施过程中，由于各种原因（如设计错误、施工条件变化、业主需求调整等）导致工程范围、工程量、设计要求、施工方式等方面的变化。这些变化可能涉及到工程成本的增加或减少、工期的延长或缩短、以及工程质量的改变等。
   • 适用场景：工程变更主要适用于建设工程项目中，当项目实际实施情况与原有设计或合同约定发生偏差时，需要进行调整或修改的情况。

总结：政府采购法第49条主要关注的是政府采购合同履行中的追加采购问题，而工程变更则更侧重于工程项目实施过程中的具体变化和调整。两者在内容、适用场景以及规范的重点上都有所不同。如果您在具体操作中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据您的实际情况给出更具体的法律建议。