刑事扣押赃款的处理是一个严谨且遵循法定程序的过程。以下是对这一问题的详细解答：

一、扣押与保管

在刑事诉讼期间，若侦查机关发现与案件有关的款项，并认为有必要进行扣押时，会依法进行扣押。扣押过程需经县级以上公安机关负责人批准，并制作《扣押物品、文件清单》，确保程序的合法性和款项登记的准确性。扣押后，司法机关会指定专人妥善保管这些赃款，以防止丢失、损坏或被调换，并建立严格的保管制度以确保其安全。

二、处理流程

1. 随案移送：扣押的赃款会随案移送至人民检察院审查起诉和人民法院审判。在移送过程中，会办理交接手续，以确保赃款的完整性和安全性。

2. 法院审查与处理：

   • 法院在审理案件时，会对扣押的赃款进行审查。若确认这些款项为犯罪所得或其孳息，法院将依法作出处理决定。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。

三、具体处理方式

1. 返还被害人：若扣押的赃款属于被害人的合法财产，法院会及时返还给被害人，以补偿其因犯罪行为遭受的财产损失。

2. 没收上缴国库：对于确认为违禁品或供犯罪所用的款项，法院将依法予以没收，并上缴国库。这是对国家法律秩序的维护，也是对犯罪行为的惩罚。

3. 特殊情形下的处理：在特定情形下，如权属明确且无争议、不损害其他被害人或利害关系人利益等，法院可能会根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，在案件审结前依法先行返还被害人的合法财产。

综上所述，刑事扣押赃款的处理过程遵循严格的法定程序，以确保款项处理的合法、公正和透明。在整个过程中，司法机关会妥善保管扣押的赃款，并根据案件审理结果依法作出处理决定。