利用征地指标取代征地批文这样的行为是不合法的。
征地批文是省级以上人民政府（包括省政府和国务院）根据《土地管理法》等相关法律规定，对符合条件的建设用地项目批准征收土地的文件，是征地行为合法性的重要依据。而征地指标，通常指的是用于衡量或控制征地规模、数量的一种标准或额度，它并不具备征地批文的法律效力。
法律依据缺失：征地指标并非法律上规定的征地合法性文件，无法替代征地批文的法律地位。利用征地指标取代征地批文，缺乏法律依据，因此是不合法的。
审批程序不合规：征地批文的取得需要经过严格的审批程序，包括项目审查、规划符合性判断、公共利益评估等多个环节。而征地指标只是用于控制征地规模的一种工具，并未经过类似的审批程序，因此不能作为征地合法性的依据。
可能损害被征地人权益：利用征地指标取代征地批文，可能会绕过法定的征地程序和补偿标准，从而损害被征地人的合法权益。征地行为必须严格遵循法定程序，并给予被征地人合理、公平的补偿安置。
综上所述，利用征地指标取代征地批文是不合法的行为。征地行为必须依法进行，确保征收主体的合法性、征收目的的合法性、征收程序的合法性以及补偿的合法性。如果被征收人面临此类情况，应及时咨询专业律师，通过法律途径维护自身的合法权益。