将物流款通过过账的方式转入个人账户，确实存在法律风险。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一. 税务风险

1. 偷税漏税风险：如果物流款直接转入个人账户，而未通过公司账户进行正规账务处理，可能导致税务部门无法准确掌握公司的真实收入情况，从而引发偷税漏税的嫌疑。根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，均属于偷税行为。

2. 税务稽查风险：税务部门在进行稽查时，如果发现公司存在物流款过账转个人的情况，可能会对公司进行更深入的税务调查，甚至可能引发税务处罚。

二. 财务风险

1. 资金混同风险：将公司物流款转入个人账户，可能导致公司资金与个人资金混同，难以区分。这不仅不利于公司的财务管理，还可能在发生纠纷时增加举证难度。

2. 内部控制风险：公司内部控制的一个重要方面就是资金管控。如果物流款可以随意转入个人账户，那么公司的内部控制将形同虚设，容易引发资金滥用、挪用等风险。

三. 法律风险

1. 违反公司法规定：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司应当建立健全财务制度，对公司的财务活动进行规范和管理。将物流款过账转个人，可能违反公司法的相关规定，损害公司利益。

2. 民事纠纷风险：如果因为物流款过账转个人而引发纠纷，公司可能面临民事诉讼的风险。例如，客户可能以公司未履行合同义务为由提起诉讼，要求公司返还物流款并承担违约责任。

综上所述，我建议公司应严格遵守相关法律法规和财务制度，确保物流款通过公司账户进行正规处理。这样不仅可以避免税务、财务和法律风险，还可以维护公司的声誉和利益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。