结论前置：开发商在办理房产证时额外收取办证费是否合法，需根据具体情况判断。若开发商仅提供必要的协助和证明文件，通常不得额外收费；若提供了额外的代办服务并收取了合理费用，且这些费用在购房合同中有明确约定，则是合法的。

分析说明：

1. 开发商不应收取的费用：

   • 法定税费，如契税、印花税、房屋维修基金等，这些费用由购房者依法向相关部门缴纳，开发商无权代收或加收。
   • 不合理代理费，若开发商声称可代理办理房产证但收取过高或不明费用，且购房合同中未明确约定，此行为不合理。

2. 开发商可能合理收取的费用：

   • 合法代办服务费，当购房合同中明确约定由开发商代为办理房产证，并规定了相应的代办服务费用时，开发商按合同约定收费合理。此费用应公开透明，并作为服务报酬涵盖资料收集、文件准备、手续办理等成本。

法律依据：

• 根据《城市房地产开发经营管理条例》，开发商应协助商品房购买人办理土地使用权变更和房屋所有权登记手续，并提供必要证明文件，此过程中通常不允许额外收费。
• 实际操作中，若开发商收取代办费、工本费等，需确保费用合理且在购房合同中有明确约定。

建议：

• 购房者在购房前应仔细审查购房合同，了解费用明细，避免不必要的经济纠纷。
• 如遇开发商不合理收费，购房者应先与开发商沟通协商，要求说明收费依据和标准；协商不成可向房地产管理部门、物价部门投诉，或通过法律途径维权。

综上所述，开发商在办理房产证时额外收取办证费的合法性需根据具体情况判断，购房者应仔细审查购房合同并了解相关法律法规，以维护自身合法权益。