医院员工住院费用减免是否合法，主要取决于减免的具体操作方式以及是否遵守了相关法律法规。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合法减免的情况：

   • 员工福利：如果医院作为雇主，在员工手册、劳动合同或集体协议中明确规定了员工住院费用减免作为员工福利的一部分，并且这一规定不违反国家法律法规，那么这种减免是合法的。
   • 保险赔付：员工如果参加了医疗保险，且保险合同中包含了住院费用赔付的条款，那么保险公司按照合同约定进行赔付也是合法的。这种情况下，虽然不是医院直接减免，但员工实际支付的住院费用会减少。

2. 可能违法的情况：

   • 无依据减免：如果医院没有合法依据（如员工手册、劳动合同、集体协议或保险合同）就擅自减免员工住院费用，这可能构成对其他患者的不公平待遇，甚至可能涉嫌违反财务、税收等相关法律法规。
   • 违规操作：即使医院有减免员工住院费用的规定，但在执行过程中如果存在违规操作，如虚构费用、篡改账目等，也是违法的。

3. 建议与注意事项：

   • 查看合同与规定：员工应仔细查看自己的劳动合同、员工手册或集体协议，了解是否有关于住院费用减免的明确规定。
   • 咨询专业人士：对于具体的减免政策或操作方式有疑问时，可以咨询医院的人力资源部门或专业的法律顾问，以确保自己的权益得到保障。
   • 遵守法律法规：无论是医院还是员工，都应严格遵守国家法律法规，确保所有减免操作都在法律允许的范围内进行。

综上所述，医院员工住院费用减免的合法性取决于具体的操作方式和是否遵守了相关法律法规。因此，在进行减免操作前，建议医院和员工都仔细了解相关规定和政策，以确保操作的合法性和合规性。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的咨询，可以直接向我提问。