征信查询授权书有电子签名但没有被授权公司公章，其合法性取决于具体情况和相关法律法规的规定。

1. 电子签名的法律效力：

   • 根据《中华人民共和国电子签名法》，电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力。因此，如果征信查询授权书上的电子签名是合法、有效的，且能够验证签署人的身份，那么该电子签名是具有法律效力的。

2. 公司公章的必要性：

   • 公司公章通常用于证明文件的正式性和公司的认可。然而，并非所有文件都必须加盖公司公章才具有法律效力。特别是在电子化的环境下，许多文件和交易都通过电子方式完成，不一定需要实体公章。

3. 具体情况分析：

   • 如果征信查询授权书是通过电子方式签署的，并且电子签名已经过验证，是合法有效的，那么即使没有加盖被授权公司的公章，该授权书仍然可能具有法律效力。
   • 但是，如果相关法律法规或行业规范明确要求某类文件必须加盖公司公章才具有法律效力，或者如果授权书中明确约定需要加盖公章才生效，那么在没有公章的情况下，该授权书可能不具有法律效力。

4. 建议：

   • 在使用征信查询授权书时，建议首先确认相关法律法规和行业规范的要求，以及授权书的具体条款。
   • 如果对授权书的合法性有疑虑，建议咨询专业律师或相关机构进行确认。

综上所述，征信查询授权书有电子签名但没有被授权公司公章的合法性取决于具体情况和相关法律法规的规定。在不确定的情况下，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。