交房多年后物业把车位抵工程款，这一行为的合法性取决于多个因素。下面我将从法律角度进行详细分析：

1. 物业对车位的处置权：

   • 首先，物业必须确保对车位拥有合法的处置权。如果车位是物业的合法财产，且没有权利瑕疵（如被抵押、查封等），那么物业有权进行处置。

2. 工程款债权的有效性：

   • 其次，需要确认工程款债权是否真实有效。如果施工方确实对物业享有工程款债权，且该债权已经到期，那么物业可以用车位来抵偿这部分债权。

3. 双方意愿与协议：

   • 物业和施工方必须就车位抵工程款的事宜达成共识，并签订书面协议。协议中应明确车位的地理位置、面积大小、所有权归属、交付日期等重要信息，以确保双方权益得到保障。

4. 法律法规的遵守：

   • 最后，整个抵偿过程必须遵守相关法律法规的强制性规定，不得触犯公共秩序和善良风俗。

如果以上条件均得到满足，那么物业用车位抵工程款的行为是合法的。然而，如果车位存在权利瑕疵，或者抵偿行为是在物业受到威胁、逼迫等非自愿的情况下产生的，那么这种抵偿行为可能是非法的。

此外，还需要注意的是，即使物业有权用车位抵工程款，也应当遵循公平、合理的原则进行抵偿，避免损害任何一方的合法权益。

综上所述，交房多年后物业把车位抵工程款的合法性取决于多个因素，包括物业对车位的处置权、工程款债权的有效性、双方的意愿与协议以及法律法规的遵守等。如果您在具体案件中遇到此类问题，建议咨询专业律师进行详细分析。