对于“非法经营电子烟货物运输中查扣咋认定”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、明确结论

非法经营电子烟货物运输中查扣，若构成犯罪，一般以非法经营罪论处；若不构成犯罪，则依据烟草专卖相关行政法规进行处罚。处理时需综合考虑货值金额、准运证情况、运输行为性质及行为人主观故意等因素。

二、非法经营罪的认定

1. 构成要件：

   • 未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品（如电子烟，若其属于烟草专卖品范畴）。
   • 经营行为达到情节严重的标准，这通常指非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在二万元以上。

2. 立案标准：

   • 香烟（或电子烟，若适用相同标准）货值金额在5万元以上，或运输香烟（或电子烟）数量达到一定标准时，视为涉嫌非法经营罪，应移送公安机关立案侦查。

3. 刑事责任：

   • 若构成非法经营罪，依据《刑法》第二百二十五条，情节严重的可处五年以下有期徒刑或拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。

三、行政处罚与刑事责任区分

• 不构成犯罪：若运输的电子烟货值金额未达到上述标准，或虽有违法事实但情节显著轻微，不构成犯罪的，将依据烟草专卖相关行政法规进行处罚，如罚款、没收违法所得等。
• 构成犯罪：若运输的电子烟货值金额较大，且行为人具有非法经营的主观故意，即明知是非法经营行为而故意实施，则可能构成非法经营罪，需承担刑事责任。

四、特殊情况处理

• 运输途中被查获：若电子烟在运输途中被查获，且行为人无法证明其有合法经营手续或准运证，则可能被视为非法经营行为。此时，无论是否完成销售，均不影响非法经营行为的认定。
• 主观故意的认定：行为人是否构成非法经营罪，还需考虑其主观上是否具有故意。若行为人能够证明其不知晓所运输的是非法经营物品，且没有故意为之，则可能减轻或免除处罚。但实践中，此类证明往往较难提供。

综上所述，非法经营电子烟货物运输中查扣的认定，需综合考虑货值金额、准运证情况、运输行为性质及行为人主观故意等因素。若构成犯罪，则以非法经营罪论处；若不构成犯罪，则依据烟草专卖相关行政法规进行处罚。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。