组织集体运动活动是否需要向政府部门申请，这主要取决于活动的性质、规模以及举办地点等因素，并受到相关法律法规的约束。以下是一些可能需要考虑的情况：

一、一般情况

对于一般性的集体运动活动，如社区内部的健身活动、学校组织的运动会等，通常不需要向政府部门申请，但应确保活动符合相关法律法规，不妨碍公共秩序，不侵犯他人合法权益，并做好相应的安全保障措施。

二、特殊情况

1. 大型体育活动

如果集体运动活动规模较大，涉及较多人员参与，或者需要占用公共场所、道路等公共资源，那么可能需要向相关部门（如体育局、公安局等）进行申请或报备。这主要是为了确保活动的安全、有序进行，以及避免对公共秩序和交通安全造成不良影响。

2. 涉及境外非政府组织的活动

如果集体运动活动是由境外非政府组织在境内开展的，那么需要严格遵守《境外非政府组织在境内开展体育活动管理办法》等相关规定。根据该办法，境外非政府组织在境内开展体育活动，应当依法设立境内代表机构，或者与中国的国家机关、人民团体、事业单位、社会组织合作进行，并办理相关报批手续。

3. 集会游行示威性质的体育活动

如果集体运动活动具有集会、游行、示威的性质，那么必须按照《中华人民共和国集会游行示威法》的规定，向主管机关（通常是公安局）提出申请并获得许可。需要注意的是，并非所有具有集会、游行、示威性质的体育活动都需要申请，如国家举行或根据国家决定举行的庆祝、纪念等活动，以及国家机关、政党、社会团体、企业事业组织依照法律、组织章程举行的集会等，可能不需要申请。

三、建议与注意事项

1. 提前了解相关法律法规：在组织集体运动活动前，建议提前了解相关法律法规和政策要求，确保活动合法合规。
2. 咨询相关部门：如果不确定是否需要向政府部门申请或报备，可以咨询当地体育局、公安局等相关部门，以获取准确的指导和帮助。
3. 做好安全保障措施：无论是否需要向政府部门申请，都应确保活动的安全进行。应制定详细的安全预案，落实安全保障措施，确保参与人员的人身安全和财产安全。

综上所述，组织集体运动活动是否需要向政府部门申请，取决于活动的性质、规模以及举办地点等因素。在组织活动时，应严格遵守相关法律法规和政策要求，确保活动的合法合规和安全进行。