公司收取未请假员工的停工损失是否违法，需视具体情况而定。

1. 若企业有合法合规的规章制度：

   • 如果企业的规章制度中明确规定了未经请假即为旷工，并可据此收取停工损失，且该制度经过民主程序制定并对全员公布，那么在此范围内收取停工损失可能并不违法。

2. 若企业缺乏相关有效制度：

   • 若企业没有明确的规章制度规定未请假即为旷工并可收取停工损失，或者相关制度未经民主程序制定或未对全员公布，那么公司直接收取未请假员工的停工损失可能涉嫌违法。

3. 从劳动者权益保护的角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》的规定，用人单位不得克扣劳动者工资。停工损失本质上是对劳动者工资的扣除，因此必须有合法合规的依据。如果公司没有合法依据就收取停工损失，可能侵犯了劳动者的劳动报酬权。

建议如下：

• 查阅规章制度：员工应首先查阅与公司签署的劳动合同以及公司的规章制度，了解公司是否有关于未请假收取停工损失的相关规定。
• 与公司沟通：若对公司的扣款行为存在异议，员工可以先行与公司进行沟通，要求公司提供合理合法的扣款理由。
• 法律途径维权：若协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以捍卫自身权益。

在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，如劳动合同、工资条、请假记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。同时，也建议企业在制定和执行规章制度时，务必确保制度的合法合规性，避免侵犯员工的合法权益。