针对您提出的问题，即商人留置三个月后无证据支持疑罪、本人也不承认疑罪，以及监委认为不配合调查会产生的后果，以下是我的详细解答：

核心结论：在刑事案件中，若商人被留置三个月后无证据支持疑罪，且本人不承认，监委不能仅凭不配合调查就对其作出不利决定。案件的处理需遵循“以事实为根据，以法律为准绳”的原则。

1. 证据原则：

   • 在刑事案件中，证据的收集、审查、判断是核心。若监委在调查过程中未能收集到充分、确凿的证据来支持对商人的疑罪，那么根据“疑罪从无”的原则，商人不能被认定为有罪。
   • 商人本人不承认疑罪，也是其行使辩护权的一种表现。在缺乏确凿证据的情况下，监委不能仅凭商人的不配合就作出有罪推定。

2. 配合调查与权利保障：

   • 监委在调查过程中，有权要求相关人员配合调查，包括提供证言、出示相关证据等。但这并不意味着被调查人员必须无条件配合，特别是在没有充分证据支持其有罪的情况下。
   • 商人作为被调查对象，有权了解自己的权利和义务，包括有权拒绝回答与案件无关的问题，有权对调查过程提出异议等。

3. 不配合调查的后果：

   • 如果商人确实存在不配合调查的行为，监委有权采取一定的措施，如冻结银行账户、查封财产等，但这些措施必须依法进行，并且需要确保不侵犯商人的合法权益。
   • 不配合调查本身并不能直接作为定罪的依据。监委在作出任何决定时，都必须基于充分、确凿的证据。

4. 后续建议：

   • 如果商人目前正面临这样的困境，建议其积极与监委沟通，了解自己的权利和义务，同时寻求专业律师的帮助，以确保自己的合法权益得到有效保障。
   • 商人也可以主动提供有利于自己的证据，以证明自己的清白。

综上所述，监委在调查过程中必须遵循法律原则，确保案件的公正、公平处理。商人作为被调查对象，也有权保障自己的合法权益。如果商人面临这样的问题，建议其积极应对，寻求专业法律帮助。