跟公司签了赔偿协议并不一定是格式条款。下面我将从几个方面来详细解释这个问题：

1. 格式条款的定义：

   • 格式条款，又称为标准条款，是指当事人为了重复使用而预先拟定，并在订立合同时未与对方协商的条款。这类条款通常是由一方（如公司）单方面制定，且在多个合同中重复使用。

2. 赔偿协议的性质：

   • 赔偿协议是双方就某一特定事项（如损害赔偿）达成的协议，其内容通常是双方协商的结果，而不是由一方单方面制定的。
   • 因此，赔偿协议本身并不符合格式条款“未与对方协商”的特征。

3. 判断赔偿协议是否为格式条款的关键：

   • 要看该赔偿协议的内容是否是由公司单方面制定，并在多个类似情况下重复使用，且未与对方进行实质性协商。
   • 如果赔偿协议的内容是双方根据具体情况协商确定的，那么它就不是格式条款。

4. 实际案例中的考量：

   • 在实际案例中，法院会综合考虑赔偿协议的具体内容、签订过程以及双方当事人的意思表示等因素，来判断该协议是否为格式条款。
   • 如果法院认定赔偿协议为格式条款，且该条款存在对一方当事人不公平、不合理的情况，那么该条款可能会被认定为无效。

综上所述，跟公司签了赔偿协议并不一定是格式条款。这取决于赔偿协议的具体内容、签订过程以及双方当事人的意思表示等因素。如果你对赔偿协议的具体内容有疑问或担忧，建议仔细审查协议条款，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。