员工违反公司制度给公司造成损失，公司确实有权索赔。但具体能否成功索赔以及索赔的金额，需根据实际情况和法律规定来判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 员工赔偿责任：

   • 若员工故意违反公司制度导致损失，如为谋取私利而泄露商业机密，员工需承担赔偿责任。此行为具有主观恶意，与公司损失存在直接因果关系。
   • 若员工因重大过失行为违反制度并造成损失，如仓库管理员值班时睡觉离岗导致仓库被盗，员工也需承担一定的赔偿责任。

2. 公司自身责任：

   • 若公司制度存在缺陷、不明确或不合理，且未对员工进行充分培训，导致员工违规，公司也需承担一定责任。公司应确保制度的合法性、合理性及有效传达。
   • 若公司管理层未能有效监督和管理员工工作，及时发现和纠正违规行为，对损失扩大部分也需负责。

3. 赔偿金额的计算与扣除：

   • 赔偿金额应根据实际损失确定，可由公司与员工协商或通过法律程序确定。
   • 根据《工资支付暂行规定》第十六条，从员工工资中扣除的赔偿部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

4. 确定赔偿责任的一般流程：

   • 公司应详细调查事件，包括损失金额、员工违规行为性质及程度、公司自身过错等。
   • 基于调查结果，公司与员工可尝试协商达成赔偿协议，考虑双方经济状况、损失程度及过错比例等因素。
   • 协商不成时，公司可通过劳动争议仲裁机构或法院提起诉讼，要求员工承担相应责任。

5. 实际操作建议：

   • 公司应及时收集并固定与经济损失有关的证据，以便争议解决时使用。
   • 在处理赔偿问题时，公司应严格遵守相关法律法规，确保赔偿过程的合法性和合规性。

综上所述，员工违反公司制度给公司造成损失时，公司有权根据法律规定和实际情况向员工索赔。但索赔过程中需考虑员工行为的性质、公司规章制度及管理的完善程度等多方面因素，并遵循相关法律规定和程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。