父母代儿子签名的协议是否有法律效力，这主要取决于儿子的民事行为能力以及代签时的具体情况。
儿子为无民事行为能力人或限制民事行为能力人：
- 如果儿子是无民事行为能力人（如不满八周岁的未成年人或不能辨认自身行为的成年人），父母作为其法定代理人，有权在法定代理权限内代其签署协议，且协议内容需符合儿子的利益。
- 如果儿子是限制民事行为能力人（如八周岁以上的未成年人或不能完全辨认自身行为的成年人），父母代签的协议需与其年龄、智力、精神健康状况相适应，超出此范围的需经儿子追认才有效。
儿子为完全民事行为能力人：
- 如果儿子是完全民事行为能力人，父母代其签名则需要有明确的授权委托书。如果父母能够提供有效的授权委托书，则代签的协议有效。
- 如果没有授权委托书或事后追认，父母代替儿子签订的协议可能因违反意思自治原则而无效。
综上所述，父母代儿子签名的协议是否有法律效力，需根据儿子的民事行为能力和代签时的具体情况来判断。在不确定的情况下，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。如果你有相关法律问题，可以直接向我提问，我会为你提供详细的法律解答。