合同内容没有履行完，合同超期后，再签补充协议延期是合法的。但这一行为的合法性取决于多个因素，以下是对此问题的详细分析：

1. 合同法的基本原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的产物，合同的内容、形式、变更和解除等都应遵循法律规定。
   • 补充协议作为合同的一部分，其签订也应遵循合同法的基本原则，即双方自愿、平等、公平、诚实信用等。

2. 补充协议的合法性：

   • 如果原合同未履行完毕且已超期，双方可以通过签订补充协议来延期履行。
   • 补充协议应明确延期的原因、延期的具体时间、延期后的履行方式等关键条款。
   • 只要补充协议的内容不违反法律法规的强制性规定，且双方意思表示真实，那么该补充协议就是合法的。

3. 延期履行的法律后果：

   • 延期履行可能会导致原合同中的某些条款需要相应调整，如履行期限、违约责任等。
   • 如果延期履行给对方造成了损失，违约方应承担相应的赔偿责任。
   • 双方应在补充协议中明确延期履行的法律后果，以避免后续产生纠纷。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在签订补充协议前，双方应充分沟通并协商，确保补充协议的内容真实、合法、有效。
   • 补充协议应以书面形式签订，并加盖双方公章或签字确认。
   • 如果原合同中有关于补充协议签订的特别约定，应遵循该约定执行。

综上所述，合同内容没有履行完且已超期后，再签补充协议延期是合法的，但应确保补充协议的内容真实、合法、有效，并明确延期履行的法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。