经过招投标的项目可以对招标文件合同的违约责任进行更改，但需满足一定条件。

首先，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。这意味着，在招投标项目中，招标人和中标人如果就违约责任的修改达成一致意见，是可以对招标文件合同中的违约责任进行更改的。

然而，需要注意的是，这种修改不能对合同的内容进行实质性变更。实质性内容通常指的是合同的主要条款，如工程范围、质量标准、价款等。违约条款虽然重要，但往往是在出现争议解决时使用的，并不直接属于商务条款。因此，在不损害第三人利益的条件下，且双方当事人对修改内容约定明确，违约责任是可以经过协商一致后进行修改的。

此外，根据《中华人民共和国招标投标法》的规定，招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。在这个过程中，如果双方需要对违约责任进行修改，应当在签订书面合同之前进行协商，并确保修改内容符合法律法规的要求。

综上所述，经过招投标的项目可以对招标文件合同的违约责任进行更改，但需满足双方当事人协商一致、不对合同内容进行实质性变更，并确保修改内容符合法律法规的要求。如果您在具体操作中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。