关于你提出的“借款合同纠纷还款保证书等证据一定会被法院收回吗”的问题，我可以明确地告诉你：在借款合同纠纷案件中，还款保证书等证据并不一定会被法院收回。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 证据提交与保管：

   • 在诉讼过程中，当事人需要向法院提交证据以支持自己的主张。这些证据包括但不限于借款合同、还款保证书、转账记录等。
   • 法院在收到证据后，会进行登记、编号，并妥善保管，以确保证据的完整性和真实性。
   • 证据原件通常会在庭审结束后退还给当事人，但法院会保留证据的复印件或扫描件作为案卷材料。

2. 证据的使用与归还：

   • 在庭审过程中，法院会根据需要对证据进行展示、质证和认证。
   • 如果证据对于案件审理至关重要，且当事人同意，法院可能会暂时扣留证据原件以便进一步审查或作为判决的依据。
   • 然而，一旦案件审理终结，且证据不再需要用于其他诉讼或执行程序，法院通常会按照程序将证据原件退还给当事人。

3. 特殊情况下的证据处理：

   • 在某些特殊情况下，如证据涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私，或者证据可能灭失、毁损等，法院可能会采取特殊措施保护证据，包括但不限于封存、扣押等。
   • 在这些情况下，证据的归还可能会受到一定的限制或延迟。

综上所述，借款合同纠纷中的还款保证书等证据并不一定会被法院收回。法院会根据案件的具体情况和证据的重要性来决定是否扣留证据原件以及扣留的时间。如果你对具体案件中的证据处理有疑问，建议直接咨询承办法官或专业律师以获取更准确的解答。