如果发现身份证被人冒用注册公司，想要查询企业内档以维护自身合法权益，你可以按照以下步骤处理，并采取相应的法律措施。在此过程中，我会为你提供相关的法律依据。

核心结论：

你应及时收集证据，通过向工商管理部门（市场监督管理局）投诉并申请查询企业内档，同时考虑报警和寻求法律帮助，以撤销被冒用的公司注册，并加强个人信息保护。

具体操作步骤及法律分析：

1. 收集证据

   • 重要性：证据是证明身份被冒用的关键，也是后续采取法律措施的基础。
   • 方法：尽可能收集涉事公司的注册信息、身份证被冒用的相关文件（如公司章程、股东会决议等）的复印件或电子版，以及你在公司注册时间段的不在场证明（如旅行票据、住宿记录等）。

2. 向工商管理部门投诉并申请查询企业内档

   • 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》及相关行政法规，市场监督管理部门有权对公司注册进行监管，并应提供企业档案查询服务。
   • 步骤：携带身份证及复印件，以及收集到的证据，前往当地市场监督管理局提交详细的投诉材料，并申请查询涉事公司的企业内档。配合管理部门的调查，等待其核实并采取相应措施，如撤销公司注册或对涉事公司进行处罚。

3. 向公安机关报案

   • 法律依据：若冒用行为涉及诈骗或其他犯罪行为，根据《中华人民共和国刑法》等相关法律，公安机关有权依法立案侦查。
   • 步骤：携带相关证据前往当地公安机关报案，详细说明情况，包括身份证被冒用的具体事实、涉事公司的相关信息等，协助警方展开调查。

4. 寻求法律帮助

   • 重要性：在处理过程中，律师可以提供专业的法律咨询和支持，帮助你更好地维护自己的权益。
   • 方法：咨询专业律师，获取法律建议，准备法律文件，并在必要时由律师代表你与相关部门沟通协商或提起诉讼。

5. 考虑提起行政诉讼

   • 法律依据：若市场监督管理等部门拒绝撤销公司登记或在合理期限内未作出处理决定，根据《中华人民共和国行政诉讼法》，你可提起行政诉讼。
   • 步骤：在律师的帮助下，准备充分的证据材料，向法院提起诉讼，要求判决登记机关撤销该公司的注册登记。

6. 加强个人信息保护

   • 重要性：预防身份证被再次冒用的关键措施。
   • 方法：提高警惕，不要随意透露身份证等敏感信息，特别是在网络环境中。定期检查个人信用报告和公司信息，及时发现并处理问题。

后续跟进：

• 保持与相关部门的沟通，及时了解处理进展。
• 根据需要，持续提供补充证据或信息以协助调查。

综上所述，面对身份证被冒用注册公司的情况，你应迅速采取行动，通过合法途径维护自己的权益。同时，加强个人信息保护意识，避免类似问题再次发生。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。