关于父亲将股权登记在儿子名下发生纠纷的处理方式，首先我们要明确，这类纠纷通常涉及家庭关系与财产权益的复杂交织，因此处理时需要格外谨慎。以下是我根据多年法律实务经验，为你提供的几个建议方向：

1. 明确股权归属：

   • 首先，要查清股权登记在儿子名下的具体原因和背景，比如是赠与、代持还是其他安排。
   • 如果存在书面协议或相关证明文件，应仔细审查其内容，以确定双方的真实意图和股权的实际归属。

2. 协商解决：

   • 家庭内部的股权纠纷往往更适合通过协商来解决。双方可以坐下来，心平气和地讨论股权的分配、管理以及未来的安排。
   • 协商时，可以邀请家族中的长辈或有影响力的人物作为调解人，以促进双方的和解。

3. 法律途径：

   • 如果协商无果，或者纠纷涉及较大的财产利益，可以考虑通过法律途径来解决。
   • 根据具体情况，可以选择提起民事诉讼，要求法院对股权的归属进行确认或分割。
   • 在诉讼过程中，应充分准备证据，包括股权登记证明、书面协议、转账记录等，以支持自己的主张。

4. 考虑家庭关系：

   • 在处理股权纠纷时，不仅要关注法律层面的问题，还要充分考虑到家庭关系的和谐与稳定。
   • 尽量避免因纠纷而破坏家庭关系，寻求一种既能维护自身权益，又能保持家庭和睦的解决方案。

综上所述，父亲将股权登记在儿子名下发生纠纷时，应首先明确股权归属，尝试通过协商来解决。如果协商无果，可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。但无论如何，都应充分考虑到家庭关系的和谐与稳定，寻求最佳解决方案。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。