公司被保全后客户转款是否会退回，取决于多个因素，主要是保全措施的具体类型以及款项的性质。以下是对这一问题的详细分析：

1. 如果款项已被法院冻结：

   • 在公司账户被法院采取保全措施，如冻结的情况下，客户转入的款项若属于被保全的范围内，那么这些款项将无法被公司自由支配，包括退回给客户。此时，款项将按照法院的裁定来处理，通常用于满足债权人的债权或用于其他法院指定的用途。
   • 若客户要求退款，公司需向法院提出申请，并说明退款的理由和依据。法院会根据实际情况，如债权关系、保全的必要性等，来决定是否允许退款。

2. 如果款项未被法院冻结，但涉及保全措施的其他限制：

   • 在某些情况下，保全措施可能不涉及账户冻结，而是对特定财产或资产进行查封、扣押等。此时，客户转入的款项若与这些特定财产或资产无关，则公司可能有权自主决定退款。
   • 但若款项与保全措施有关联，比如是用于支付被保全资产的维护费用或相关税费等，那么退款仍需受法院监督或批准。

3. 款项性质的影响：

   • 如果客户转入的款项是定金、预付款或具有特定用途的专款，且这些款项的退还涉及合同违约或商业纠纷，那么退款问题将依据合同条款和法律规定来处理。
   • 若款项仅为一般性的转账，且与公司被保全的资产或业务无关，那么公司理论上可以自主决定是否退款，但需考虑商业信誉和客户关系等因素。

4. 法律建议和后续行动：

   • 在面临公司被保全且客户要求退款的情况下，建议公司首先明确保全措施的具体内容和限制，以及款项的性质和用途。
   • 若退款涉及法律纠纷或合同违约，应及时咨询专业律师（如陈晓辉律师，擅长公司事务和股权转让领域），以获取针对性的法律建议。
   • 公司应保留所有与退款相关的证据和文件，如转账记录、合同、通信记录等，以备不时之需。

综上所述，公司被保全后客户转款是否会退回，需根据保全措施的具体类型、款项的性质以及实际情况来判断。在涉及法律问题时，建议公司及时寻求专业法律帮助。