公司对股东回购承担保证责任，在符合特定条件时是有效的。具体来说：

1. 有效条件：

   • 内部决议程序：公司必须履行为股东提供担保的内部决议程序，如股东会或股东大会的决议。这是确保公司担保行为合法性的关键步骤。
   • 外部投资人审查：外部投资人应善意审查相关的内部决策文件，以确认公司担保的合法性。如果外部投资人未经审查或明知未经决议而接受担保，可能会影响担保的效力。

2. 法律效果：

   • 如果公司履行了内部决议程序，且外部投资人善意审查了相关文件，那么公司对股东回购承担的保证责任应属有效。
   • 如果因外部投资人未经审查导致约定无效，法院可能会考量双方是否存在过错等因素，来分担责任。

3. 实务经验：

   • 在股东间进行对赌时，可以在回购条款中约定，当回购条件达成时，控股大股东承担股权回购的主债务，而目标公司对控股股东的主债务承担连带担保责任。
   • 但务必确保目标公司为控股大股东提供担保的事项已经按照公司章程的规定通过了股东会等内部决策程序，并且外部投资者留存了相关的内部决策文件。

4. 法律依据：

   • 《公司法》第十六条第二款规定，公司为公司股东或者实际控制人提供担保的，必须经股东会或者股东大会决议。
   • 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国担保法〉若干问题的解释》第七条规定，如果主合同有效而担保合同无效，且担保人有过错，担保人应承担民事责任的部分不应超过债务人不能清偿部分的二分之一。

综上所述，公司对股东回购承担保证责任在符合特定条件时是有效的。如果您在具体操作中遇到此类问题，建议详细咨询专业律师以确保合规性。