关于商家拒绝开具纸质版发票是否违法，这个问题需要根据具体情况来分析。

首先，从一般情况来看，根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在收取款项时有义务向付款方开具发票。这意味着，当消费者提出需要纸质发票时，商家应当提供。如果商家拒绝开具纸质发票，如以“发票用完了”、“不开发票给优惠”等理由推脱，那么这种行为是违法的。税务机关有权责令商家改正，并处以1万元以下的罚款；如果商家有违法所得，还将被没收。

然而，在特定情况下，商家不提供纸质发票并不违法。随着电子技术的进步和税务政策的更新，电子发票已经得到广泛应用，并且具备与纸质发票同等的法律效力。如果商家提前告知消费者将以电子发票代替纸质发票，并且消费者表示同意，或者当地税务政策鼓励并支持电子发票的使用，那么商家不提供纸质发票是合法的。但无论是纸质发票还是电子发票，商家都必须确保发票的真实性和合法性，并妥善保存相关记录。

综上所述，商家拒绝开具纸质版发票是否违法取决于具体情境。在一般交易场景中，商家有义务提供纸质发票；但在符合电子发票使用规定且消费者同意的情况下，商家不提供纸质发票是合法的。无论如何，商家都应遵守相关法律法规，确保所提供的发票真实、合法，并妥善保存相关记录。如果消费者遇到商家拒绝开具发票的情况，可以向税务机关举报投诉，以维护自己的合法权益。