亲子鉴定并不一定要用父亲的样本，也可以选择母亲的样本或者父母双方的样本。具体解释如下：

1. 亲子鉴定的基本类型：

   • 二联体鉴定：指的是父母中的一方（父亲或母亲）与孩子之间的鉴定。这种鉴定方式适用于只需要确认单一方与孩子关系的情况。
   • 三联体鉴定：指的是父母双方与孩子共同进行的鉴定。这种方式更全面，因为它能同时确认父亲和母亲与孩子之间的亲子关系。

2. 选择父亲或母亲的原因：

   • 在大多数情况下，亲子鉴定首选与父亲进行，这主要是因为男性在传统家庭结构中常常是主要的亲子关系确认对象。
   • 然而，这并不意味着亲子鉴定只能和父亲做。母亲同样可以通过亲子鉴定确认自己与孩子的关系，特别是在孩子可能是通过试管婴儿等方式出生的情况下。

3. 实际应用中的灵活性：

   • 委托人需要根据自己的具体情况选择合适的亲子鉴定方式。
   • 如果只是怀疑父亲的身份，那么选择与父亲进行二联体鉴定即可。
   • 如果需要全面确认家庭成员的关系，或者在某些法律程序中（如上户口），户籍部门可能会要求提供父母与孩子三人之间的亲子关系证明，这时就需要进行三联体鉴定。

综上所述，亲子鉴定并不是只能与父亲进行，而是可以根据实际需要灵活选择父亲、母亲或者父母双方的样本进行鉴定。如果您有具体的亲子鉴定需求或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况给出更详细的建议和指导。