如果公司有调休制度，但调休过期了，员工仍然有权要求公司支付加班费。下面我来详细解释一下这个问题：
首先，我们要明确调休和加班费的关系。调休通常是公司为了补偿员工在休息日加班而给予的一种休息权益，而加班费则是员工在加班后应得的货币补偿。当公司规定了调休制度，并规定了调休的有效期时，如果员工在有效期内没有使用完调休，那么调休过期后，员工是否还能要求加班费，就需要根据具体情况来分析了。
如果公司无法安排调休：根据劳动法的规定，公司在员工加班后应优先安排调休，如果无法安排调休，则需要支付加班费。因此，如果调休过期了，但公司实际上已经无法再安排员工调休，那么员工有权要求公司支付加班费。
如果公司能安排调休但未安排：如果公司在员工加班后能够安排调休，但由于某种原因（如管理疏忽、员工自身原因等）导致调休过期未休，这种情况下，员工仍然有权要求公司支付加班费，因为公司未能及时履行其安排调休的义务。
证据保留的重要性：无论在哪种情况下，员工要求公司支付加班费时，都需要提供充分的证据来证明自己的加班事实和调休过期的情况。这些证据可以包括加班记录、调休单、与公司相关人员的沟通记录等。
综上所述，如果公司有调休制度，但调休过期了，员工在符合上述条件的情况下，仍然有权要求公司支付加班费。如果公司在员工提出要求后拒绝支付，员工可以通过法律途径来维护自己的合法权益。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更具体的法律建议。