行政立案后双方和解一般不能撤案。以下是对此问题的详细分析：
行政案件撤案的相关规定
在行政案件中，一旦行政立案，就意味着行政机关对特定事项已经启动了调查处理程序。行政行为具有公定力、确定力、拘束力和执行力，行政机关需依法履行职责，以维护公共利益和行政管理秩序。因此，行政立案后，双方即使达成和解，案件通常也不能撤销。
和解在行政案件中的作用
虽然双方和解不能直接导致撤案，但和解情况可以作为行政机关作出最终决定时的参考因素之一。在法定范围内，行政机关可以考虑和解的情况，适当从轻、减轻或变更处罚等。例如，对于一些情节较轻且双方和解良好的行政处罚案件，行政机关可能会给予相对较轻的处罚。
特殊情况说明
若被告改变被诉行政行为，且原告同意并申请撤诉，经法院裁定准许后，案件可以撤销。但这需要满足特定的条件，并且需要经过法院的严格审查。
法律依据
《中华人民共和国行政诉讼法》第六十二条规定：“人民法院对行政案件宣告判决或者裁定前，原告申请撤诉的，或者被告改变其所作的行政行为，原告同意并申请撤诉的，是否准许，由人民法院裁定。”
综上所述，行政立案后双方和解一般不能撤案。但和解情况可以作为行政机关作出最终决定时的参考因素，在法定范围内适当影响处罚结果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。