注册社团是否合法，主要取决于该社团是否按照国家法律法规在县级以上民政部门进行了注册登记。合法社会组织是根据国家相关法律法规在民政部门注册登记的非营利法人，它们在社会中有序开展互益或公益活动，具有非营利性、非行政性和自治性等属性。

相反，非法社会组织则是未经民政部门注册登记，但活跃在社会上的“机构”。这些机构往往以公益或互益为幌子，利用迷惑性的身份去欺骗公众，谋取私利。它们的行为不仅损害了合法社会组织的声誉，还可能侵占资源，甚至牵连到合法社会组织承担不必要的责任。

为了防范非法社会组织，公众在与社会组织开展合作或参与公益活动时，应该通过正规渠道核实社会组织的合法性。例如，可以访问“中国社会组织政务服务平台”或“慈善中国”等平台，查询社会组织的登记信息、年检情况、信用记录等。如果发现涉嫌违法违规的线索，应及时向当地民政部门举报。

因此，注册社团本身不是非法的，但必须经过合法的注册登记程序。未经注册登记的社团是非法的，不能开展活动，否则将面临法律制裁。如果你有意注册社团，建议咨询当地民政部门或相关法律专业人士，了解具体的注册流程和要求，确保社团的合法性。