关于三方协议是否可以盖个体工商户的章，这个问题其实涉及到具体的协议内容和签订方的规定。但一般来说，三方协议是可以盖个体工商户的章的，特别是在一些特定的业务场景中，如银税三方协议的签订。

以深圳个体工商户银税三方协议的签订为例，个体工商户在办理了单位社保账户后，需要签订银税三方协议。这个过程中，个体工商户是可以作为签订方之一，并盖上自己的章的。签订流程通常可以通过线上渠道，如深圳税务服务号进行，也可以携带相关材料线下到税务窗口办理。

另外，值得注意的是，如果个体工商户没有对公账户，也可以通过特定的流程签订三方协议。比如，可以先进行存款账户账号报告，选择个人储蓄账户作为账户性质，并在后续的三方协议签订过程中，选择下载打印协议书，然后到开户银行线下办理。待银行办结后，再返回电子税务局进行勾选验证即可完成签订。

总的来说，三方协议是否可以盖个体工商户的章，取决于具体的协议内容和签订方的规定。在大多数情况下，特别是涉及到个体工商户作为协议一方的业务场景中，是可以盖个体工商户的章的。但为了确保协议的合法性和有效性，建议在签订前仔细阅读协议内容，并咨询相关专业人士的意见。