不是，即使被告为破产企业，管理人和原告达成调解，法院仍然可以制作调解书。针对您提出的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 破产程序中调解的合法性

• 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第九十七条的规定，调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。这一规定并未对调解双方的身份作出特殊限制，因此，即使被告为破产企业，只要调解协议是双方自愿达成的，且内容不违反法律规定，法院就可以制作调解书。

二. 破产管理人的法律地位

• 根据《中华人民共和国企业破产法》第二十五条的规定，管理人履行下列职责：……（七）代表债务人参加诉讼、仲裁或者其他法律程序……。这意味着在破产程序中，管理人有权代表债务人参与诉讼和调解。因此，管理人与原告达成的调解协议是合法有效的。

三. 调解书在破产程序中的效力

• 调解书一旦经双方当事人签收，即具有法律效力。在破产程序中，调解书的效力同样受到法律的保护。如果调解书的内容涉及到债务人的财产分配或债务清偿等问题，管理人应当按照调解书的内容执行。当然，如果调解书的内容与破产程序的目标相冲突，或者可能损害其他债权人的利益，管理人可以向法院提出异议，请求法院对调解书进行审查。

四. 特殊情况下的处理

• 在某些特殊情况下，如破产企业已经进入清算程序，且调解协议的内容涉及到清算财产的分配等核心问题，管理人可能需要事先征得债权人会议或法院的同意。但这并不意味着法院不能制作调解书，而是管理人在执行调解书前需要履行相应的程序。

总结：即使被告为破产企业，管理人和原告达成调解后，法院仍然可以制作调解书。调解书的效力受到法律的保护，但管理人在执行调解书时需要遵守破产程序的相关规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。