销售种子未备案将面临责令改正和罚款的处罚，具体罚款金额根据违法情节而定。

一. 法律依据与处理流程

1. 法律依据：根据《中华人民共和国种子法》第三十八条，种子生产经营者在特定情况下，如专门经营不再分装的包装种子或受委托生产、代销种子时，虽不需要办理种子生产经营许可证，但必须向当地农业农村、林业草原主管部门备案。未按规定备案即销售种子的行为违法。
2. 处理流程：若被发现销售未备案的种子，县级以上农业农村、林业草原主管部门将责令改正，并处以相应罚款。

二. 罚款标准

1. 一般情况：对于未及时备案的销售行为，将处以2000元以上10000元以下的罚款。
2. 特定情形：若销售的是非主要农作物商品种子且未备案，或经营不再分装的包装种子、代销种子未备案，除责令改正外，还将没收种子和违法所得，并处以违法所得二倍的罚款；若无违法所得，则处以1000元以上1万元以下罚款。

三. 实际案例

• 例如，某农资经营部因销售未备案的蔬菜种子被查处，货值金额共计530元，已销售139袋，违法所得412元。最终，该经营部被责令停止经营未备案种子，下架剩余种子，并补备案，同时被罚款2000元。

四. 合规建议

• 为避免法律风险，种子销售者应严格遵守相关法律法规，及时了解并履行备案义务。在销售前，应确认是否需要备案及备案的具体要求和流程，确保合规经营。

综上所述，销售种子未备案将面临明确的法律责任和罚款。因此，我建议种子销售者务必重视备案工作，确保合规经营，以避免不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。