每日万分之五的违约金，法院在判决书中可能会根据实际情况进行调整，具体调整方案取决于案件的具体情况和法律规定。以下是对此问题的详细分析：

一. 违约金调整的法律依据

根据《民法典》第五百八十五条第二款规定：“约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。” 这是法院调整违约金的法律依据。

二. 违约金调整的实践情况

1. 违约金过高的认定

   • 在实践中，如果合同约定的违约金（如每日万分之五）被认为过分高于守约方因违约行为所遭受的实际损失，违约方可以请求法院或仲裁机构予以适当减少。
   • 例如，在商品房买卖合同纠纷中，若合同约定的逾期交房违约金为每日万分之五，而开发商主张该违约金过高，法院可能会考虑购房人的实际损失（如已付房款被占用期间的贷款利息）来判断违约金是否过高。

2. 调整方案

   • 法院在调整违约金时，会综合考虑合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等因素，根据公平原则和诚实信用原则作出裁决。
   • 具体的调整方案可能包括：将违约金调整为已付房款贷款利息的130%（如某些高级法院的裁判观点）；或者调整为已付房款的贷款利息（银行同期贷款利率，现按LPR计算）；或者根据实际损失等自由裁量并综合调整至一个合理的水平。

三. 案例分析

• 在一个具体的案例中，若二手房买卖合同约定逾期过户和逾期交房的违约金为每日总房价的万分之五，而总房价高达数百万，每日的违约金数额可能相当可观。若法院认为该违约金标准过高，可能会根据案件的具体情况（如违约天数、过错程度、守约方损失等）对违约金进行调整。

四. 我的观点

• 每日万分之五的违约金标准在合同中是合法的，但法院在判决时可能会根据实际情况进行调整。因此，在签订合同时，双方应合理约定违约金标准，以避免后续纠纷。
• 若遇到违约金调整的问题，我建议当事人应充分准备证据，证明自己的实际损失或对方违约行为的严重程度，以便在诉讼中争取更有利的裁决。

总结：每日万分之五的违约金在判决书中是否调整以及如何调整，取决于案件的具体情况和法律规定。法院在调整违约金时会综合考虑多种因素，以维护公平和正义。如有进一步需要，您可以继续咨询我。