长期同居并有两个孩子，这种情况下双方并不构成法律意义上的夫妻关系，而是属于同居关系。在我国，结婚必须以登记为要件，未经合法登记的婚姻关系不受法律保护。下面我对这一结论进行详细解释：

1. 同居关系的定义：

   • 同居关系是指男女双方未办理结婚登记手续而共同生活的关系。这种关系在法律上并不被视为婚姻关系，因此不受《婚姻法》等相关法律的保护和约束。

2. 同居关系与婚姻关系的区别：

   • 婚姻关系：需要双方到婚姻登记机关进行结婚登记，领取结婚证，从而确立夫妻关系。婚姻关系受法律保护，夫妻享有相互的权利和义务。
   • 同居关系：双方虽然共同生活，但并未进行结婚登记，因此不构成婚姻关系。同居关系不受法律保护，双方之间的权利和义务需要依据其他法律规定或双方约定来确定。

3. 同居关系下的子女问题：

   • 虽然双方属于同居关系，但所生的子女在法律上与婚生子女享有同等的权利。父母对子女有抚养、教育的义务，子女对父母有赡养、扶助的义务。
   • 同居关系下的子女问题，如抚养权、监护权、探视权等，需要依据《民法典》等相关法律规定来处理。

4. 法律建议：

   • 对于长期同居并育有子女的双方，建议尽快考虑是否办理结婚登记，以明确双方的法律关系，保护双方的合法权益。
   • 如果双方决定分手或离婚（对于已登记的情况），需要妥善处理子女抚养、财产分割等问题，避免产生不必要的法律纠纷。

综上所述，长期同居并有两个孩子的情况下，双方属于同居关系而非婚姻关系。在处理相关问题时，需要依据相关法律规定和双方约定来明确各自的权利和义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。