针对您提出的“民事纠纷经法院调解还款三年后不还了是否可以提请强制执行”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、强制执行申请的基本规定

在民事纠纷中，若经法院调解后达成还款协议，但一方在约定期限内未履行还款义务，另一方有权向法院申请强制执行。关于申请强制执行的期限，主要遵循以下规定：

1. 有明确还款期限的情况：

   • 若调解书中明确规定了还款期限，权利人需在还款期限届满后的两年内向法院提出强制执行申请。例如，若调解书规定对方应于某年某月某日前还款，则权利人需在该日期后的两年内申请强制执行。

2. 无还款期限或不明确的情况：

   • 若调解书中未明确规定具体的还款期限，权利人通常可在知道或应当知道权利被侵害之日起的两年内（实际操作中多遵循此规定，尽管诉讼时效可能为三年）提出申请。

二、您情况的具体分析

根据您所述，民事纠纷经法院调解后已过去三年，且对方未履行还款义务。此时，是否可以申请强制执行需考虑以下因素：

• 是否超过申请期限：若调解书中明确规定了还款期限，且该期限距今已超过两年，则您可能已超出申请强制执行的期限。若未明确规定还款期限，则需考虑您是否自知道或应当知道权利被侵害之日起两年内提出了申请。

• 是否存在时效中断或中止的情形：如期间内向对方主张权利、对方承诺还款等导致时效重新计算的情况，或因不可抗力等法定原因导致时效中止的情况。若存在此类情形，可能延长申请强制执行的期限。

三、申请强制执行的程序与建议

1. 准备材料：

   • 若您确定未超过申请期限，或存在时效中断、中止的情形，可准备强制执行申请书、调解书原件及复印件、申请人身份证明及能证明对方未履行义务的证据等材料。

2. 提交申请：

   • 将准备好的材料提交至有管辖权的法院，由法院对申请进行审查。若审查通过，法院将受理并启动执行程序。

3. 关注执行进展：

   • 在执行过程中，保持与法院的沟通联系，及时了解执行进展，以便采取进一步措施。

4. 法律咨询：

   • 若您对申请强制执行的具体程序或相关法律规定存在疑问，建议咨询专业律师以获取更准确的法律建议。

四、超过时效后的处理建议

若您已超出申请强制执行的期限，且不存在时效中断、中止的情形，则法院可能不会受理您的强制执行申请。此时，您可考虑以下途径：

• 沟通协商：尝试与对方进行沟通，看是否能通过协商的方式解决欠款问题。
• 法律咨询与诉讼：咨询专业律师，了解是否还有其他法律途径可供选择，如重新提起诉讼（需考虑诉讼时效等因素）。

综上所述，民事纠纷经法院调解还款三年后是否可以申请强制执行，需根据具体情况而定。若您确定未超过申请期限或存在时效中断、中止的情形，可按照相关程序向法院提出申请。若已超出期限，则可考虑其他途径解决欠款问题。