办孤儿证时，如果怀疑申请人与孩子的关系，确实可能会要求进行亲子鉴定。下面我来详细解释一下这个问题：

首先，孤儿证的办理通常是为了确认孩子的孤儿身份，以便享受相关的社会福利和保障。在办理过程中，相关部门会严格审查申请人的资格和提交的材料。

如果在这个过程中，有关部门或机构对申请人与孩子的关系产生怀疑，比如怀疑申请人并非孩子的法定监护人或存在其他关系不清的情况，他们可能会要求申请人进行亲子鉴定。亲子鉴定是一种科学、准确的方式，可以通过DNA检测来确认申请人与孩子之间的血缘关系。

需要注意的是，亲子鉴定并不是办理孤儿证的必经程序，只有在特定情况下，当有关部门对申请人与孩子的关系产生合理怀疑时，才会提出这一要求。

因此，在办理孤儿证时，建议申请人提前了解相关的政策和程序，并准备好必要的材料和证明。如果确实需要进行亲子鉴定，也应该积极配合，以确保办理过程的顺利进行。

希望这个解释能帮到你，如果你还有其他关于婚姻家庭或合同纠纷方面的问题，欢迎随时向我咨询。