涉密文件在单位找不到，档案员是否会被判刑，这取决于具体情况。以下是对此问题的详细分析：
一般情况下的责任：
- 如果涉密文件的丢失是由于档案员的疏忽或管理不善导致的，但并未造成严重的后果，那么档案员可能会受到单位的处分，如警告、记过、调离岗位等，但通常不会直接被判刑。
涉及刑事责任的情况：
- 根据《保密法》的相关规定，如果档案员严重违反保密规定，导致涉密文件丢失，且该丢失行为涉嫌泄露国家秘密，那么档案员可能会面临刑事责任。在这种情况下，如果经司法机关调查确认构成犯罪，档案员是有可能被判刑的。
法律建议：
- 对于档案员来说，首先应尽快向单位报告文件的丢失情况，并配合单位进行调查。
- 如果涉及法律责任，建议档案员及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
- 在日常工作中，档案员应严格遵守保密规定，确保涉密文件的安全管理。
综上所述，涉密文件在单位找不到，档案员是否会被判刑取决于具体情况。如果仅是管理上的疏忽，通常不会直接被判刑；但如果涉嫌泄露国家秘密并构成犯罪，则有可能面临刑事责任。因此，档案员应时刻保持警惕，确保涉密文件的安全。