和也公司在法律上是合法的。然而，其具体的合法性还需根据其经营行为、产品质量以及是否遵守国家相关法律法规来进行具体评估。以下是对此问题的详细分析：
一. 公司注册与资质
公司注册信息：和也健康科技有限公司是一家合法注册的公司，拥有相应的营业执照和经营资质。根据爱企查的信息，该公司成立于2010年7月29日，注册资本为6000万元，实缴资本为4750万元，法定代表人为方彦雯。这表明和也公司在法律上是经过正规注册的企业。
高新技术企业资质：和也公司被认定为高新技术企业，这表明其在技术研发和创新方面具有一定的实力，并且符合国家对高新技术企业的认定标准。
二. 产品质量与销售行为
产品质量：和也公司作为一家生产销售磁健康寝具等产品的企业，其产品的质量必须符合国家相关标准。如果和也公司的产品存在质量问题，将可能面临消费者退货、更换或修理的要求，甚至可能受到相关监管部门的处罚。然而，目前并没有公开信息表明和也公司的产品质量存在严重问题。
销售行为：和也公司在销售过程中必须遵守国家相关法律法规，如《中华人民共和国消费者权益保护法》和《中华人民共和国反不正当竞争法》等。如果和也公司在销售过程中存在虚假宣传、欺诈消费者等行为，将可能构成违法。例如，根据公开信息，和也公司的一家专卖店曾因虚假宣传被罚款20万元，这表明该公司在某些销售行为上确实存在违法问题。
三. 公司声誉与合规经营
公司声誉：和也公司在行业内具有一定的知名度和美誉度，这与其长期以来注重产品质量和诚信经营是分不开的。然而，公司声誉并不能完全代表其所有经营行为都合法合规，还需要结合具体的经营行为来判断。
合规经营：和也公司应持续加强合规经营意识，确保所有经营行为都符合国家相关法律法规的要求。这包括但不限于产品质量控制、广告宣传的真实性、消费者权益保护等方面。
综上所述，和也公司在法律上是合法的，但其在经营过程中必须严格遵守国家相关法律法规，确保产品质量和销售行为的合法性。针对和也公司个别专卖店存在的违法问题，公司应加强内部管理和监督，防止类似问题再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。