关于“行政违法行为由部队哪个部门处理”的问题，首先需要明确的是，行政违法行为的处理通常属于地方行政机关的职责范畴，而非部队直接处理。部队内部有其自身的纪律和法规，对于违反军事纪律或军事法规的行为，由部队内部的相应部门（如军务部门、纪检部门等）进行处理。

然而，当行政违法行为涉及到部队人员或部队相关事务时，地方行政机关在处理时可能会与部队进行协调或沟通，以确保处理的公正性和合理性。但具体的处理部门和处理程序，仍然需要依据地方行政机关的相关规定和程序来进行。

因此，对于“行政违法行为由部队哪个部门处理”的问题，不能一概而论地说由部队某个特定部门处理。而是需要根据具体情况，由地方行政机关依据相关法律法规和程序进行处理，必要时与部队进行协调或沟通。

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