果树赔偿的起诉并不必须由直系亲属进行。具体分析如下：
在涉及果树赔偿的问题上，首先要明确的是，赔偿的权利主体通常是果树的所有权人或者合法的使用权人。这意味着，谁有权对果树主张权利，谁就有资格提起诉讼来要求赔偿。
如果果树是父亲个人所有：那么父亲自己就是最适合的起诉主体，他可以直接向法院提起诉讼来要求赔偿。
如果果树是家庭共有财产：在这种情况下，家庭中的任何一个成员都有可能成为起诉的主体，但通常需要得到其他共有人的同意或者授权。如果父亲作为家庭的一员，他当然有权提起诉讼，但也不是必须由他去起诉，其他共有人同样可以。
如果父亲已经去世，果树作为遗产：在这种情况下，果树会按照继承法的规定由继承人继承。此时，有权提起诉讼的就是这些继承人，他们可以是直系亲属，也可以是其他按照法律规定或者遗嘱继承的继承人。
综上所述，果树赔偿的起诉并不必须由直系亲属进行。具体由谁来起诉，取决于果树的所有权归属以及家庭财产的具体情况。如果你在这方面有具体的法律问题或者需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。