逾期交付但当事人另有约定除外的，应首先遵循当事人的约定处理。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
一. 合同约定优先原则
- 依据：根据《民法典》的相关规定，当事人之间订立的有效合同，对双方均具有法律约束力。在合同中，如果双方对逾期交付有特别约定，如免责条款、延期交付的补偿方式等，这些约定将优先于一般的法律规定适用。
- 实例：假设甲乙双方在合同中约定，如因特定原因（如不可抗力）导致逾期交付，甲方不承担违约责任。那么，在这种情况发生时，即使甲方逾期交付，也不构成违约，因为双方已有此约定。
二. 当事人约定的具体内容
- 分析：当事人另有约定时，需要仔细审查约定的内容。约定可能包括逾期交付的免责事由、延期交付的具体时间、逾期交付的补偿方式（如支付违约金、继续履行合同等）以及双方的其他权利义务。
- 处理：根据约定的具体内容，双方应按照约定执行。如果约定明确且合法，双方应遵守约定；如果约定不明确或存在争议，双方应协商解决，或依法通过诉讼或仲裁方式解决。
三. 法律规定的补充适用
- 依据：当事人没有约定或约定不明确时，将适用《民法典》等法律关于逾期交付的相关规定。例如，出卖人迟延交付房屋或者买受人迟延支付购房款，经催告后在三个月的合理期限内仍未履行，当事人一方请求解除合同的，应予支持，但当事人另有约定的除外。
- 实例：如果合同中未对逾期交付作出约定，且双方无法协商一致，那么甲方逾期交付时，乙方可以依据法律规定要求甲方承担违约责任，如支付违约金、继续履行合同等。
综上所述，逾期交付但当事人另有约定除外的，应首先遵循当事人的约定处理。如果约定明确且合法，双方应遵守约定；如果约定不明确或存在争议，双方应协商解决或依法通过诉讼或仲裁方式解决。在处理过程中，应充分考虑合同约定优先原则以及法律规定的补充适用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。