本组给农民确权土地只确权三分之二，预留机动地三分之一是否合法，需根据具体情况分析。
一. 预留机动地的合法性
- 一般情况：根据《中华人民共和国农村土地承包法》的相关规定，农村土地承包应当坚持公开、公平、公正的原则，保障农民的土地承包权益。如果预留机动地是为了调整承包地或者用于其他公共利益，且经过了法定程序（如村民会议或村民代表会议讨论决定），并报乡（镇）人民政府和县级人民政府农业农村、林业和草原等主管部门批准，那么这种预留是合法的。
- 特殊情况：但如果预留机动地未经法定程序，或者预留的比例过高，损害了农民的土地承包权益，那么这种预留就是不合法的。
二. 确权三分之二土地的合法性
- 确权土地的面积应当与农民实际承包的土地面积相符。如果只确权三分之二，而另外三分之一被无故预留，且未经过法定程序，那么这种确权行为可能损害了农民的合法权益，是不合法的。
三. 综合分析
- 因此，判断本组给农民确权土地只确权三分之二，预留机动地三分之一是否合法，关键在于预留机动地是否经过了法定程序，以及预留的比例是否合理。如果预留机动地经过了法定程序，且预留比例合理，那么这种做法是合法的；反之，则是不合法的。
我建议您向当地农业农村、林业和草原等主管部门咨询，了解预留机动地的具体情况和法律依据。如果确实存在违法行为，您可以依法维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。