结论前置：自然人独资公司可以持股另一个独资公司，但需严格遵守相关法律法规，并确保投资行为的合法性与合理性。
详细分析
法律依据：
- 根据《公司法》等相关法律法规，自然人独资公司作为非法人组织，具有投资其他公司的资格。无论是自然人、法人还是非法人组织，均可依法成为公司的股东，只要符合公司设立和股权取得的法定程序。
操作要点与注意事项：
- 遵守设立与变更程序：如果自然人独资公司要全额控股一个新设公司，需按照《公司法》规定的公司设立程序，提交相关申请文件，并办理注册登记。如果是通过股权收购实现控股，需确保收购过程合法，并办理股权变更登记手续。
- 满足资本与出资要求：自然人独资公司应确保满足拟投资公司的注册资本要求，并足额出资。
- 信息披露与透明度：在商事登记和经营过程中，应按照规定进行信息披露，明确股东结构和控股关系。
- 特殊规定注意：对于一人有限责任公司，存在特殊规定，即一个自然人只能投资设立一个一人有限责任公司，且该公司不得再投资设立新的一人有限责任公司。但这一规定并不限制自然人独资公司投资其他类型的公司。
- 风险管理与商业合理性：在投资过程中，应充分考虑商业合理性，评估投资风险，并通过完善公司治理结构等方式来防范风险。
- 遵守其他法律法规：除了《公司法》外，还需遵守税法等其他相关法律法规，确保投资行为的全面合规性。
实例说明
假设张先生拥有一家自然人独资公司A，现在他想投资并控股另一家独资公司B。在这种情况下，张先生可以通过A公司向B公司进行投资，只要符合B公司的设立条件和相关法律法规，就可以实现控股。但张先生需要确保整个投资过程合法合规，包括签订合法的投资协议、办理股权变更手续等，并遵守相关税务规定。
综上所述，自然人独资公司持股另一个独资公司在法律上是可行的，但在实际操作过程中需严格遵守相关法律法规，并注重风险管理和商业合理性。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。