关于您提出的“债权超过诉讼时效但仍在合同有效期内，诉讼时效如何计算”的问题，首先我们要明确几个核心点：诉讼时效与合同有效期是两个不同的概念，它们各自独立存在并发挥作用。下面我将详细解释这一问题：
核心结论
- 诉讼时效过期后，债权本身依然存在，但债权人会丧失胜诉权。除非债务人自愿履行或双方达成新的协议，否则债权人难以通过法律途径强制要求债务人履行债务。
- 合同有效期是双方约定的合同履行期限，与诉讼时效无直接关联。合同有效期届满后，若合同未续签或未履行完毕，双方的权利义务关系可能终止，但这不影响诉讼时效的计算。
详细解释
诉讼时效的计算：
- 债权人诉讼时效一般为三年，起算点通常是从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 若借款合同约定了还款期限，诉讼时效从还款期限届满之日起算；若未约定还款期限，则债权人可以随时要求还款，但要给债务人一定合理准备时间，在该合理准备时间届满后开始计算诉讼时效。
- 在诉讼时效期间内，债权人向债务人主张过权利，诉讼时效会中断，从中断时起重新计算。
- 如果债权人因不可抗力等不能行使请求权的障碍，诉讼时效会中止，自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
合同有效期的意义：
- 合同有效期是双方约定的合同履行期限，它规定了合同双方在一定时间内应履行的权利和义务。
- 合同有效期届满后，若合同未续签或双方未达成新的协议，合同关系自然终止。
- 但合同有效期的届满并不影响债权人依据法律规定向债务人主张权利的诉讼时效。
特殊情况
- 债务人自愿履行：即使诉讼时效已经过期，如果债务人自愿履行债务，债权人仍有权受领，并且债务人不得以诉讼时效期间届满为由请求返还。
- 达成新的协议：债权人与债务人可以就原债务达成新的还款协议，新协议受法律保护，诉讼时效重新起算。
法律建议
- 及时行使权利：债权人应密切关注诉讼时效的计算，及时通过法律途径向债务人主张权利，避免因诉讼时效经过而使债权得不到法律强制力保护。
- 保留证据：在诉讼时效期间内，债权人应保留向债务人主张权利的证据，以应对可能的诉讼时效中断或中止情况。
- 咨询专业律师：如遇复杂情况或不确定如何计算诉讼时效，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
希望以上解释能对您有所帮助。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的解答，请随时向我提问。