招标代理费按中标价的比例计算，通常采用差额定率累进法，并依据原国家计委发布的《招标代理服务收费管理暂行办法》（计价格[2002]1980号）中规定的费率标准执行。以下是具体的计算方法和注意事项：

一. 主要计算方法：

1. 计费基数：以每个中标通知书的中标金额为计费基数。

2. 费率标准：根据《招标代理服务收费管理暂行办法》，不同中标金额区间对应不同的费率，且货物、服务、工程三类项目的费率也有所区别。例如，对于工程项目，中标金额在100万元以下可能费率为1.0%，而500万至1000万元之间费率为0.55%等，具体费率需参照该办法中的详细规定。

3. 计算方式：采用差额定率累进法，即按照中标金额的不同区间分别计算费用，然后累加得到总费用。例如，若中标金额为2000万元，则需按照不同区间（如100万元以下、100-500万元、500-1000万元、1000-2000万元）的费率分别计算各区间的费用，并求和得到总费用。

二. 其他考虑因素：

• 附加调整系数：根据提供的服务内容不同，如单独提供编制招标文件服务的，可按规定标准的一定比例计收。
• 优惠系数：根据市场行情及双方协商，可对服务收费进行一定比例的优惠。
• 项目类型：工程、服务、货物等不同类别的项目费率不同，需根据具体项目类型选择相应的费率标准。

三. 实际操作建议：

• 在实际操作中，建议首先明确项目类型和中标金额，然后参照《招标代理服务收费管理暂行办法》中的费率标准进行计算。
• 考虑附加调整系数和优惠系数对费用的影响，并与招标代理机构进行充分协商，以确保费用的合理性和公正性。

综上所述，招标代理费按中标价的比例计算是一个综合考虑多种因素的过程，需严格参照相关规定并执行差额定率累进法进行计算。如有进一步需要，您可以继续咨询我。